Struktur Organisasi Kecamatan Banguntapan, berikut personil yang menduduki jabatan (per awal Januari 2019) terdiri atas :
- Camat : Drs. FAUZAN MU'ARIFIN
- Sekretaris Kecamatan : MOCHAMMAD MIZBAH, SIP
- Sub Bagian Umum : RIBUT BIMO HARYO TEJO, SH
- Sub Bagian Program dan Keuangan : ARI SUSILOWATI, SIP
- Seksi Tata Pemerintahan : AFIF UMAHATUN, SH
- Seksi Ketentraman dan Ketertiban : INDRA KURNIAWAN, S.STP
- Seksi Pelayanan : WARTININGSIH, SIP
- Seksi Ekonomi, Pembangunan dan Lingkungan Hidup : Ir. ISHARYANTI
- Seksi Kemasyarakatan : SURYADI RAHARJO, SH
