Struktur Organisasi Kecamatan Banguntapan, berikut personil yang menduduki jabatan (per awal Januari 2019) terdiri atas :
- Camat : I NYOMAN GUNARSA, S.Psi, M.Psi
- Sekretaris Kecamatan : Rr NURUL ADIATI HARDJONO SIWI, S.Ip, M.Eng
- Sub Bagian Umum : SUBARJO, S.IP, M.Si
- Sub Bagian Program dan Keuangan : ROMADHON AKHIRIAWAN IS ARDIANTO, S.STP
- Seksi Tata Pemerintahan : THOMAS BASUKI RAHARJO, SE
- Seksi Ketentraman dan Ketertiban : INDRA KURNIAWAN, S.STP
- Seksi Pelayanan : WARTININGSIH, SIP
- Seksi Ekonomi, Pembangunan dan Lingkungan Hidup : Ir. ISHARYANTI
- Seksi Kemasyarakatan : SURYADI RAHARJO, SH
